Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms