Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prkab2Q6PAM0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prkab2Q6PAM0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prkab2Q6PAM0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prkab2Q6PAM0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms