Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms