Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pprc1Q6NZN1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pprc1Q6NZN1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms