Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarca2Q6DIC0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms