Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp11bQ6DFW5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms