Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms