Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp7Q6A4J8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp7Q6A4J8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms