Protein–RNA interactions for Protein: Q6A068

Cdc5l, Cell division cycle 5-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc5lQ6A068 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc5lQ6A068 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdc5lQ6A068 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms