Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms