Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trim24Q64127 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms