Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Zfp248Q640N4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Zfp248Q640N4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Zfp248Q640N4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Zfp248Q640N4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Zfp248Q640N4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Zfp248Q640N4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Zfp248Q640N4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Zfp248Q640N4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Zfp248Q640N4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Zfp248Q640N4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Zfp248Q640N4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Zfp248Q640N4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Zfp248Q640N4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Zfp248Q640N4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp248Q640N4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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