Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms