Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn4Q62472 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn4Q62472 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lcn4Q62472 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lcn4Q62472 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lcn4Q62472 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lcn4Q62472 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lcn4Q62472 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lcn4Q62472 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lcn4Q62472 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lcn4Q62472 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lcn4Q62472 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms