Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms