Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nptx1Q62443 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms