Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtafrQ62035 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtafrQ62035 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtafrQ62035 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PtafrQ62035 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PtafrQ62035 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtafrQ62035 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtafrQ62035 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PtafrQ62035 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtafrQ62035 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtafrQ62035 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtafrQ62035 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtafrQ62035 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PtafrQ62035 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtafrQ62035 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtafrQ62035 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtafrQ62035 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtafrQ62035 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtafrQ62035 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PtafrQ62035 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtafrQ62035 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PtafrQ62035 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtafrQ62035 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtafrQ62035 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtafrQ62035 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtafrQ62035 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtafrQ62035 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtafrQ62035 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtafrQ62035 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtafrQ62035 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PtafrQ62035 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtafrQ62035 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtafrQ62035 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtafrQ62035 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtafrQ62035 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtafrQ62035 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtafrQ62035 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtafrQ62035 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtafrQ62035 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PtafrQ62035 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtafrQ62035 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtafrQ62035 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PtafrQ62035 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtafrQ62035 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtafrQ62035 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PtafrQ62035 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PtafrQ62035 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtafrQ62035 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtafrQ62035 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtafrQ62035 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtafrQ62035 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtafrQ62035 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtafrQ62035 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtafrQ62035 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtafrQ62035 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtafrQ62035 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtafrQ62035 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtafrQ62035 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtafrQ62035 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtafrQ62035 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtafrQ62035 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtafrQ62035 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtafrQ62035 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PtafrQ62035 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtafrQ62035 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtafrQ62035 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtafrQ62035 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PtafrQ62035 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PtafrQ62035 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms