Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Odf1Q61999 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Odf1Q61999 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Odf1Q61999 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Odf1Q61999 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Odf1Q61999 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Odf1Q61999 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Odf1Q61999 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Odf1Q61999 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Odf1Q61999 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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