Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms