Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd55bQ61476 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms