Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms