Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcf12Q61286 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms