Protein–RNA interactions for Protein: Q61189

Clns1a, Methylosome subunit pICln, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clns1aQ61189 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Clns1aQ61189 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Clns1aQ61189 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Clns1aQ61189 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Clns1aQ61189 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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