Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Usf1Q61069 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Usf1Q61069 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usf1Q61069 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usf1Q61069 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usf1Q61069 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Usf1Q61069 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Usf1Q61069 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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