Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TmpoQ61033 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms