Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms