Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Laptm4aQ60961 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Laptm4aQ60961 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms