Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms