Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf4Q60793 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms