Protein–RNA interactions for Protein: Q60775

Elf1, ETS-related transcription factor Elf-1, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf1Q60775 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Elf1Q60775 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Elf1Q60775 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms