Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms