Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcf4Q60722 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf4Q60722 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms