Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samhd1Q60710 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms