Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CttnQ60598 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CttnQ60598 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CttnQ60598 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CttnQ60598 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CttnQ60598 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CttnQ60598 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CttnQ60598 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.9 ms