Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms