Protein–RNA interactions for Protein: Q5U901

Cpa6, Carboxypeptidase A6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa6Q5U901 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpa6Q5U901 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpa6Q5U901 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpa6Q5U901 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpa6Q5U901 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpa6Q5U901 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cpa6Q5U901 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpa6Q5U901 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms