Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc125Q5U465 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc125Q5U465 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc125Q5U465 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc125Q5U465 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc125Q5U465 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc125Q5U465 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc125Q5U465 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc125Q5U465 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc125Q5U465 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc125Q5U465 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc125Q5U465 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc125Q5U465 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc125Q5U465 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc125Q5U465 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc125Q5U465 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms