Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms