Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ggnbp2Q5SV77 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ggnbp2Q5SV77 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms