Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam71bQ5STT6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms