Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav6-2Q5R1I4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms