Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRE5

Proser1, Proline and serine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Proser1Q5PRE5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Proser1Q5PRE5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Proser1Q5PRE5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms