Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms