Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2f8Q58FA4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms