Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL18

Tmem171, Transmembrane protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem171Q4KL18 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms