Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3lQ4KL14 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms