Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Lrrc43Q3V0L5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Lrrc43Q3V0L5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Lrrc43Q3V0L5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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