Protein–RNA interactions for Protein: Q3V096

Ankrd42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd42Q3V096 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd42Q3V096 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd42Q3V096 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd42Q3V096 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms