Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc114Q3UX62 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms