Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms